Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
TTF2Q9UNY4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTF2Q9UNY4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTF2Q9UNY4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms