Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX7Q9UNH6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX7Q9UNH6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX7Q9UNH6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms