Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN42

ATP1B4, Protein ATP1B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B4Q9UN42 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ATP1B4Q9UN42 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
ATP1B4Q9UN42 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
ATP1B4Q9UN42 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
ATP1B4Q9UN42 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
ATP1B4Q9UN42 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
ATP1B4Q9UN42 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
ATP1B4Q9UN42 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
ATP1B4Q9UN42 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
ATP1B4Q9UN42 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
ATP1B4Q9UN42 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
ATP1B4Q9UN42 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
ATP1B4Q9UN42 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ATP1B4Q9UN42 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ATP1B4Q9UN42 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ATP1B4Q9UN42 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ATP1B4Q9UN42 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ATP1B4Q9UN42 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
ATP1B4Q9UN42 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
ATP1B4Q9UN42 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
ATP1B4Q9UN42 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ATP1B4Q9UN42 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
ATP1B4Q9UN42 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
ATP1B4Q9UN42 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
ATP1B4Q9UN42 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
ATP1B4Q9UN42 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
ATP1B4Q9UN42 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ATP1B4Q9UN42 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
ATP1B4Q9UN42 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ATP1B4Q9UN42 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ATP1B4Q9UN42 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ATP1B4Q9UN42 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ATP1B4Q9UN42 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
ATP1B4Q9UN42 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
ATP1B4Q9UN42 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
ATP1B4Q9UN42 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
ATP1B4Q9UN42 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
ATP1B4Q9UN42 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ATP1B4Q9UN42 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ATP1B4Q9UN42 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ATP1B4Q9UN42 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ATP1B4Q9UN42 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
ATP1B4Q9UN42 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ATP1B4Q9UN42 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ATP1B4Q9UN42 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ATP1B4Q9UN42 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
ATP1B4Q9UN42 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ATP1B4Q9UN42 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ATP1B4Q9UN42 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ATP1B4Q9UN42 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ATP1B4Q9UN42 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
ATP1B4Q9UN42 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ATP1B4Q9UN42 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
ATP1B4Q9UN42 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ATP1B4Q9UN42 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ATP1B4Q9UN42 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ATP1B4Q9UN42 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ATP1B4Q9UN42 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
ATP1B4Q9UN42 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ATP1B4Q9UN42 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ATP1B4Q9UN42 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
ATP1B4Q9UN42 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 886.3 ms