Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS4

PRPF19, Pre-mRNA-processing factor 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF19Q9UMS4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRPF19Q9UMS4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF19Q9UMS4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF19Q9UMS4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms