Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ALKQ9UM73 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ALKQ9UM73 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ALKQ9UM73 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ALKQ9UM73 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ALKQ9UM73 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ALKQ9UM73 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ALKQ9UM73 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ALKQ9UM73 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ALKQ9UM73 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ALKQ9UM73 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
ALKQ9UM73 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ALKQ9UM73 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
ALKQ9UM73 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ALKQ9UM73 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ALKQ9UM73 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ALKQ9UM73 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ALKQ9UM73 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC34■■■■□ 3.03
ALKQ9UM73 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
ALKQ9UM73 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ALKQ9UM73 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ALKQ9UM73 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ALKQ9UM73 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ALKQ9UM73 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
ALKQ9UM73 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ALKQ9UM73 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ALKQ9UM73 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
ALKQ9UM73 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
ALKQ9UM73 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ALKQ9UM73 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ALKQ9UM73 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ALKQ9UM73 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ALKQ9UM73 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ALKQ9UM73 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ALKQ9UM73 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ALKQ9UM73 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
ALKQ9UM73 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ALKQ9UM73 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ALKQ9UM73 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ALKQ9UM73 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ALKQ9UM73 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ALKQ9UM73 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
ALKQ9UM73 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
ALKQ9UM73 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
ALKQ9UM73 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ALKQ9UM73 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ALKQ9UM73 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ALKQ9UM73 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ALKQ9UM73 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ALKQ9UM73 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
ALKQ9UM73 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ALKQ9UM73 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ALKQ9UM73 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ALKQ9UM73 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ALKQ9UM73 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ALKQ9UM73 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
ALKQ9UM73 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
ALKQ9UM73 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ALKQ9UM73 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ALKQ9UM73 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
ALKQ9UM73 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
ALKQ9UM73 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ALKQ9UM73 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ALKQ9UM73 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ALKQ9UM73 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ALKQ9UM73 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ALKQ9UM73 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ALKQ9UM73 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ALKQ9UM73 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ALKQ9UM73 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ALKQ9UM73 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ALKQ9UM73 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ALKQ9UM73 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ALKQ9UM73 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ALKQ9UM73 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ALKQ9UM73 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ALKQ9UM73 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ALKQ9UM73 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ALKQ9UM73 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ALKQ9UM73 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ALKQ9UM73 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ALKQ9UM73 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ALKQ9UM73 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ALKQ9UM73 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ALKQ9UM73 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ALKQ9UM73 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ALKQ9UM73 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ALKQ9UM73 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ALKQ9UM73 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ALKQ9UM73 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ALKQ9UM73 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ALKQ9UM73 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ALKQ9UM73 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ALKQ9UM73 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ALKQ9UM73 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
ALKQ9UM73 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ALKQ9UM73 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ALKQ9UM73 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ALKQ9UM73 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
ALKQ9UM73 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms