Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIMKLBQ9ULI2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIMKLBQ9ULI2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIMKLBQ9ULI2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RIMKLBQ9ULI2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RIMKLBQ9ULI2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIMKLBQ9ULI2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms