Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC2LQ9UL33 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRAPPC2LQ9UL33 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC2LQ9UL33 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms