Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGA11Q9UKX5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGA11Q9UKX5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGA11Q9UKX5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGA11Q9UKX5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGA11Q9UKX5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA11Q9UKX5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA11Q9UKX5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA11Q9UKX5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA11Q9UKX5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA11Q9UKX5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGA11Q9UKX5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA11Q9UKX5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA11Q9UKX5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA11Q9UKX5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA11Q9UKX5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA11Q9UKX5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA11Q9UKX5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA11Q9UKX5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGA11Q9UKX5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA11Q9UKX5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA11Q9UKX5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA11Q9UKX5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA11Q9UKX5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA11Q9UKX5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA11Q9UKX5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA11Q9UKX5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA11Q9UKX5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA11Q9UKX5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA11Q9UKX5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA11Q9UKX5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA11Q9UKX5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA11Q9UKX5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA11Q9UKX5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms