Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK13

ZNF221, Zinc finger protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF221Q9UK13 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF221Q9UK13 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF221Q9UK13 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF221Q9UK13 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF221Q9UK13 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF221Q9UK13 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF221Q9UK13 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF221Q9UK13 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF221Q9UK13 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF221Q9UK13 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF221Q9UK13 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF221Q9UK13 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF221Q9UK13 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF221Q9UK13 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF221Q9UK13 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF221Q9UK13 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF221Q9UK13 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF221Q9UK13 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF221Q9UK13 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF221Q9UK13 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF221Q9UK13 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF221Q9UK13 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF221Q9UK13 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF221Q9UK13 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF221Q9UK13 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF221Q9UK13 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF221Q9UK13 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF221Q9UK13 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF221Q9UK13 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF221Q9UK13 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF221Q9UK13 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF221Q9UK13 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF221Q9UK13 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF221Q9UK13 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF221Q9UK13 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF221Q9UK13 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF221Q9UK13 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF221Q9UK13 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF221Q9UK13 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF221Q9UK13 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF221Q9UK13 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF221Q9UK13 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms