Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GGA2Q9UJY4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GGA2Q9UJY4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GGA2Q9UJY4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GGA2Q9UJY4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GGA2Q9UJY4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA2Q9UJY4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA2Q9UJY4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA2Q9UJY4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA2Q9UJY4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA2Q9UJY4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA2Q9UJY4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GGA2Q9UJY4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GGA2Q9UJY4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GGA2Q9UJY4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms