Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ1

LAMP5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP5Q9UJQ1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LAMP5Q9UJQ1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
LAMP5Q9UJQ1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LAMP5Q9UJQ1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms