Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
VAX2Q9UIW0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VAX2Q9UIW0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms