Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SRP68Q9UHB9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SRP68Q9UHB9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SRP68Q9UHB9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SRP68Q9UHB9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SRP68Q9UHB9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SRP68Q9UHB9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SRP68Q9UHB9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SRP68Q9UHB9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SRP68Q9UHB9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SRP68Q9UHB9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SRP68Q9UHB9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SRP68Q9UHB9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
SRP68Q9UHB9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SRP68Q9UHB9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SRP68Q9UHB9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SRP68Q9UHB9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SRP68Q9UHB9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SRP68Q9UHB9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SRP68Q9UHB9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SRP68Q9UHB9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SRP68Q9UHB9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SRP68Q9UHB9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SRP68Q9UHB9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SRP68Q9UHB9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SRP68Q9UHB9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SRP68Q9UHB9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SRP68Q9UHB9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SRP68Q9UHB9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SRP68Q9UHB9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SRP68Q9UHB9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SRP68Q9UHB9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SRP68Q9UHB9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SRP68Q9UHB9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SRP68Q9UHB9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SRP68Q9UHB9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SRP68Q9UHB9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SRP68Q9UHB9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SRP68Q9UHB9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SRP68Q9UHB9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SRP68Q9UHB9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SRP68Q9UHB9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SRP68Q9UHB9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SRP68Q9UHB9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SRP68Q9UHB9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SRP68Q9UHB9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SRP68Q9UHB9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SRP68Q9UHB9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SRP68Q9UHB9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SRP68Q9UHB9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SRP68Q9UHB9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SRP68Q9UHB9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms