Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EBF1Q9UH73 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EBF1Q9UH73 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EBF1Q9UH73 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms