Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MTRF1LQ9UGC7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MTRF1LQ9UGC7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MTRF1LQ9UGC7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MTRF1LQ9UGC7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms