Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
COPS7AQ9UBW8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COPS7AQ9UBW8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COPS7AQ9UBW8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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