Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC5

MYO1A, Unconventional myosin-Ia, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1AQ9UBC5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYO1AQ9UBC5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MYO1AQ9UBC5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYO1AQ9UBC5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYO1AQ9UBC5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms