Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB6

NCDN, Neurochondrin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCDNQ9UBB6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NCDNQ9UBB6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCDNQ9UBB6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCDNQ9UBB6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms