Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
REREQ9P2R6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
REREQ9P2R6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
REREQ9P2R6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
REREQ9P2R6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
REREQ9P2R6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
REREQ9P2R6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
REREQ9P2R6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
REREQ9P2R6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
REREQ9P2R6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
REREQ9P2R6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
REREQ9P2R6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
REREQ9P2R6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
REREQ9P2R6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
REREQ9P2R6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
REREQ9P2R6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
REREQ9P2R6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
REREQ9P2R6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
REREQ9P2R6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
REREQ9P2R6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
REREQ9P2R6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
REREQ9P2R6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
REREQ9P2R6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
REREQ9P2R6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
REREQ9P2R6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
REREQ9P2R6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
REREQ9P2R6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
REREQ9P2R6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
REREQ9P2R6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC35.47■■■■□ 3.27
REREQ9P2R6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
REREQ9P2R6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
REREQ9P2R6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
REREQ9P2R6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
REREQ9P2R6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
REREQ9P2R6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
REREQ9P2R6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
REREQ9P2R6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
REREQ9P2R6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
REREQ9P2R6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
REREQ9P2R6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
REREQ9P2R6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
REREQ9P2R6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
REREQ9P2R6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
REREQ9P2R6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
REREQ9P2R6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
REREQ9P2R6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
REREQ9P2R6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
REREQ9P2R6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
REREQ9P2R6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
REREQ9P2R6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
REREQ9P2R6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
REREQ9P2R6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
REREQ9P2R6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
REREQ9P2R6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
REREQ9P2R6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
REREQ9P2R6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
REREQ9P2R6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
REREQ9P2R6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
REREQ9P2R6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
REREQ9P2R6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
REREQ9P2R6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
REREQ9P2R6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
REREQ9P2R6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
REREQ9P2R6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
REREQ9P2R6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
REREQ9P2R6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
REREQ9P2R6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms