Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SH3BP4Q9P0V3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4Q9P0V3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4Q9P0V3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms