Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0T7

TMEM9, Transmembrane protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9Q9P0T7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM9Q9P0T7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM9Q9P0T7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM9Q9P0T7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM9Q9P0T7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM9Q9P0T7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM9Q9P0T7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM9Q9P0T7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM9Q9P0T7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM9Q9P0T7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM9Q9P0T7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM9Q9P0T7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM9Q9P0T7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM9Q9P0T7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM9Q9P0T7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM9Q9P0T7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM9Q9P0T7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM9Q9P0T7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM9Q9P0T7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM9Q9P0T7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM9Q9P0T7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM9Q9P0T7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM9Q9P0T7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM9Q9P0T7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM9Q9P0T7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM9Q9P0T7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM9Q9P0T7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM9Q9P0T7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM9Q9P0T7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM9Q9P0T7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM9Q9P0T7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM9Q9P0T7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM9Q9P0T7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms