Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HACD3Q9P035 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HACD3Q9P035 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HACD3Q9P035 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms