Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMOD2Q9NZR1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMOD2Q9NZR1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMOD2Q9NZR1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TMOD2Q9NZR1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TMOD2Q9NZR1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
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