Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMOD4Q9NZQ9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.51■■■□□ 2
TMOD4Q9NZQ9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMOD4Q9NZQ9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms