Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM6

PKD2L2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L2Q9NZM6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKD2L2Q9NZM6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKD2L2Q9NZM6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PKD2L2Q9NZM6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PKD2L2Q9NZM6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKD2L2Q9NZM6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKD2L2Q9NZM6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PKD2L2Q9NZM6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKD2L2Q9NZM6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKD2L2Q9NZM6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKD2L2Q9NZM6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKD2L2Q9NZM6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2L2Q9NZM6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2L2Q9NZM6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2L2Q9NZM6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2L2Q9NZM6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PKD2L2Q9NZM6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKD2L2Q9NZM6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms