Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTEL1Q9NZ71 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RTEL1Q9NZ71 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms