Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK5

MRPL39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL39Q9NYK5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MRPL39Q9NYK5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRPL39Q9NYK5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms