Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM53CQ9NYF3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM53CQ9NYF3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM53CQ9NYF3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms