Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VNN3Q9NY84 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VNN3Q9NY84 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VNN3Q9NY84 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms