Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY72

SCN3B, Sodium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN3BQ9NY72 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCN3BQ9NY72 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCN3BQ9NY72 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCN3BQ9NY72 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms