Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY26

SLC39A1, Zinc transporter ZIP1, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A1Q9NY26 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC39A1Q9NY26 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC39A1Q9NY26 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC39A1Q9NY26 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC39A1Q9NY26 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC39A1Q9NY26 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC39A1Q9NY26 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC39A1Q9NY26 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC39A1Q9NY26 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC39A1Q9NY26 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms