Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NDE1Q9NXR1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDE1Q9NXR1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NDE1Q9NXR1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms