Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TOR4AQ9NXH8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOR4AQ9NXH8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TOR4AQ9NXH8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms