Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MKS1Q9NXB0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MKS1Q9NXB0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MKS1Q9NXB0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MKS1Q9NXB0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms