Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM248Q9NWD8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM248Q9NWD8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM248Q9NWD8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms