Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDX18Q9NVP1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX18Q9NVP1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDX18Q9NVP1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms