Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PARVAQ9NVD7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PARVAQ9NVD7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PARVAQ9NVD7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARVAQ9NVD7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PARVAQ9NVD7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARVAQ9NVD7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARVAQ9NVD7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARVAQ9NVD7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARVAQ9NVD7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARVAQ9NVD7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARVAQ9NVD7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARVAQ9NVD7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARVAQ9NVD7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARVAQ9NVD7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARVAQ9NVD7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PARVAQ9NVD7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PARVAQ9NVD7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARVAQ9NVD7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARVAQ9NVD7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARVAQ9NVD7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARVAQ9NVD7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARVAQ9NVD7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARVAQ9NVD7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARVAQ9NVD7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARVAQ9NVD7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARVAQ9NVD7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARVAQ9NVD7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARVAQ9NVD7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARVAQ9NVD7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARVAQ9NVD7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARVAQ9NVD7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARVAQ9NVD7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARVAQ9NVD7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARVAQ9NVD7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARVAQ9NVD7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARVAQ9NVD7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARVAQ9NVD7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PARVAQ9NVD7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PARVAQ9NVD7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARVAQ9NVD7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARVAQ9NVD7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARVAQ9NVD7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PARVAQ9NVD7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARVAQ9NVD7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARVAQ9NVD7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PARVAQ9NVD7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARVAQ9NVD7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARVAQ9NVD7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PARVAQ9NVD7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARVAQ9NVD7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARVAQ9NVD7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARVAQ9NVD7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARVAQ9NVD7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARVAQ9NVD7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARVAQ9NVD7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARVAQ9NVD7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARVAQ9NVD7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARVAQ9NVD7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARVAQ9NVD7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms