Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTM9

CUTC, Copper homeostasis protein cutC homolog, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUTCQ9NTM9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CUTCQ9NTM9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUTCQ9NTM9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUTCQ9NTM9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUTCQ9NTM9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUTCQ9NTM9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CUTCQ9NTM9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CUTCQ9NTM9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUTCQ9NTM9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUTCQ9NTM9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUTCQ9NTM9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUTCQ9NTM9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUTCQ9NTM9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CUTCQ9NTM9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUTCQ9NTM9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUTCQ9NTM9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CUTCQ9NTM9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms