Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOMER2Q9NSB8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOMER2Q9NSB8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOMER2Q9NSB8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOMER2Q9NSB8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOMER2Q9NSB8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOMER2Q9NSB8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOMER2Q9NSB8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOMER2Q9NSB8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOMER2Q9NSB8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOMER2Q9NSB8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOMER2Q9NSB8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOMER2Q9NSB8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOMER2Q9NSB8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOMER2Q9NSB8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOMER2Q9NSB8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HOMER2Q9NSB8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HOMER2Q9NSB8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HOMER2Q9NSB8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOMER2Q9NSB8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
HOMER2Q9NSB8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms