Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB6BQ9NRW1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB6BQ9NRW1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms