Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
DUOX1Q9NRD9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DUOX1Q9NRD9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DUOX1Q9NRD9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
DUOX1Q9NRD9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DUOX1Q9NRD9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DUOX1Q9NRD9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DUOX1Q9NRD9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
DUOX1Q9NRD9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DUOX1Q9NRD9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DUOX1Q9NRD9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DUOX1Q9NRD9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DUOX1Q9NRD9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DUOX1Q9NRD9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DUOX1Q9NRD9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DUOX1Q9NRD9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DUOX1Q9NRD9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DUOX1Q9NRD9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DUOX1Q9NRD9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DUOX1Q9NRD9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DUOX1Q9NRD9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DUOX1Q9NRD9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
DUOX1Q9NRD9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DUOX1Q9NRD9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DUOX1Q9NRD9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DUOX1Q9NRD9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
DUOX1Q9NRD9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
DUOX1Q9NRD9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DUOX1Q9NRD9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DUOX1Q9NRD9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
DUOX1Q9NRD9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DUOX1Q9NRD9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DUOX1Q9NRD9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DUOX1Q9NRD9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DUOX1Q9NRD9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DUOX1Q9NRD9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DUOX1Q9NRD9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DUOX1Q9NRD9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DUOX1Q9NRD9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DUOX1Q9NRD9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DUOX1Q9NRD9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DUOX1Q9NRD9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DUOX1Q9NRD9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DUOX1Q9NRD9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DUOX1Q9NRD9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DUOX1Q9NRD9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DUOX1Q9NRD9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DUOX1Q9NRD9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DUOX1Q9NRD9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DUOX1Q9NRD9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DUOX1Q9NRD9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DUOX1Q9NRD9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DUOX1Q9NRD9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DUOX1Q9NRD9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DUOX1Q9NRD9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DUOX1Q9NRD9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DUOX1Q9NRD9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
DUOX1Q9NRD9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
DUOX1Q9NRD9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DUOX1Q9NRD9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DUOX1Q9NRD9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.9 ms