Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FBXO6Q9NRD1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FBXO6Q9NRD1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO6Q9NRD1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO6Q9NRD1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO6Q9NRD1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO6Q9NRD1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO6Q9NRD1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO6Q9NRD1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO6Q9NRD1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO6Q9NRD1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO6Q9NRD1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO6Q9NRD1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO6Q9NRD1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO6Q9NRD1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO6Q9NRD1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO6Q9NRD1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO6Q9NRD1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO6Q9NRD1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO6Q9NRD1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO6Q9NRD1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO6Q9NRD1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO6Q9NRD1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO6Q9NRD1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms