Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIT2Q9NQR4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NIT2Q9NQR4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms