Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A3Q9NQ40 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC52A3Q9NQ40 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC52A3Q9NQ40 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms