Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
A4GALTQ9NPC4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
A4GALTQ9NPC4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
A4GALTQ9NPC4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms