Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC2

KCNK9, Potassium channel subfamily K member 9, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK9Q9NPC2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCNK9Q9NPC2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCNK9Q9NPC2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCNK9Q9NPC2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms