Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPHS2Q9NP85 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NPHS2Q9NP85 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NPHS2Q9NP85 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NPHS2Q9NP85 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPHS2Q9NP85 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPHS2Q9NP85 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPHS2Q9NP85 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPHS2Q9NP85 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NPHS2Q9NP85 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPHS2Q9NP85 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPHS2Q9NP85 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPHS2Q9NP85 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPHS2Q9NP85 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPHS2Q9NP85 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPHS2Q9NP85 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPHS2Q9NP85 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPHS2Q9NP85 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPHS2Q9NP85 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPHS2Q9NP85 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPHS2Q9NP85 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPHS2Q9NP85 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPHS2Q9NP85 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPHS2Q9NP85 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NPHS2Q9NP85 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPHS2Q9NP85 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPHS2Q9NP85 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NPHS2Q9NP85 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPHS2Q9NP85 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPHS2Q9NP85 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NPHS2Q9NP85 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms