Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
VTA1Q9NP79 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
VTA1Q9NP79 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
VTA1Q9NP79 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
VTA1Q9NP79 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VTA1Q9NP79 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VTA1Q9NP79 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VTA1Q9NP79 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VTA1Q9NP79 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VTA1Q9NP79 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms