Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ABCB9Q9NP78 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
ABCB9Q9NP78 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ABCB9Q9NP78 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms