Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD90

NEUROD4, Neurogenic differentiation factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD4Q9HD90 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD4Q9HD90 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD4Q9HD90 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD4Q9HD90 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD4Q9HD90 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD4Q9HD90 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD4Q9HD90 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD4Q9HD90 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD4Q9HD90 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD4Q9HD90 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD4Q9HD90 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD4Q9HD90 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD4Q9HD90 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD4Q9HD90 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD4Q9HD90 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD4Q9HD90 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD4Q9HD90 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NEUROD4Q9HD90 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEUROD4Q9HD90 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEUROD4Q9HD90 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms